На какие вопросы ищет ответ волновая генетика

Горячие вопросы биологии, на которые ищет ответ волновая генетика
 
Несмотря на успехи молекулярной генетики и клеточной биологии, до сих пор ключевые механизмы знаковых функций генетического аппарата остаются непонятными. А по сути, без ответа остается фундаментальный мировоззренческий вопрос – каким образом сложнейшие биосистемы «сворачиваются» в относительно простых хромосомах и «разворачиваются» во взрослые организмы? Особенно ярко это проявилось в после публикации работы, в которой команде Р.Прюита (Пардуйский университета в США) удалось изящно доказать, что законы Менделя в генетике не всегда выполняются 1 . Это проявилось в том, что во взрослых растениях Arabidopsis фенотипически проявился нормальный ген HotHead , которого не было в исходных мутантных семенах, но который был у предков растения. Отсутствующий в хромосомах «виртуальный» ген HotHead заменил реальный мутантный ген hothead .
Объяснения этому феномену пока не дано. Высказано предположение, что нормальный ген хранился как его ревертазная РНК копия в геноме или цитоплазме мутантного растения. Это слабое и уязвимое объяснение, не имеющее экспериментального доказательства, что признают и сами авторы. Допустим, что это предположение правильное, тогда все эволюционно «старые» и не мутантные гены должны храниться в РНК ревертазных копиях по крайней мере в половых клетках. В такой ситуации они должны быть размером с Монблан. Необъяснимый с позиций классической генетики феномен возврата предкового гена поднял на поверхность целый ряд замалчиваемых и нерешенных кардинальных вопросов генетики и эмбриологии.

  • a / Воблирование 3-го нуклеотида в кодоне делает каноническую таблицу генетического кода ареной потенциальных ошибок при синтезе белков, поскольку она автоматически демонстрирует омонимии значащих дублетов в кодонах, когда пары одинаковых дублетов кодируют разные аминокислоты 2 . При этом третьим нуклеотидом кодона может быть любой из четырех, что постулировал F .Крик 3 . Тем не менее, ошибки при выборе аминокислот чрезвычайно маловероятны, и это удивительный факт. Объяснение его выводит нас в иные мерности реального генетического кода, отвечающего за развитие всего организма из яйцеклетки, а не только за биосинтез белков;

  • b / Ситуация, когда 98% генома эукариот считают "мусором", в лучшем случае, неким странным помощником триплетного кода или «кладбищем» вирусных геномов;

  • c / 2% кодирующей ДНК человека (около 30тыс. генов) оказалась весьма близкими таковым свиней, ослов, мух и даже E.coli. Вместе с тем, в ДНК человека найдены тысячи генов, не кодирующих белки 12 (в дополнение к известным т.н. «молчащим» генам), что ставит вопрос (пока без ответа) об их назначении;

  • d / гены по непонятным причинам и законам транспозицируются в 3- D континууме хромосом, причем в «точно назначенные» места. Непонятно «кем» и как «назначаются» эти места и каким образом происходит точное «пилотирование и посадка» транспозонов;
  • e / гены по непонятным причинам разбиты на интроны и экзоны, при этом биологический смысл интронов не ясен;

  • f / матрично независимый синтез определенных видов РНК (т.н. 6 S РНК), осуществляемый Q репликазой и синтез РНК с помощью полимеразы бактериофага T 7 RNA 4,5 , которые нарушают канонический принцип чисто вещественной репликации ДНК РНК;
  • q / фантомный листовой эффект, когда часть живого листа растения помнит его целый образ 6,7 ;

  • h / непонятные по механизмам дистантные функции селекторных генов морфогенеза (например, ген kruppel у дрозофил), когда их продукты синтезируются в одном месте эмбриона, а действие проявляется в другом, отстоящем на сотни клеток.

    Все эти и другие мало понимаемые проявления знаковых функций хромосом заставляют думать и доказывать, что генетическая память имеет иные атрибуты, существенно дополняющие белковый код. Вероятно, они имеют волновую природу 8,9,10,11 .

    Вопросы поставлены. Наши работы в какой-то мере на них отвечают.Это и является главным содержанием данного сайта.
  • _________________________________________________________________________________________________________________________
  1. Lolle S.J., Victor J.L., Young J.M., Pruitt R.E. Genome-wide non-mendelian inheritance of extra genomic information in Arabidopsis. Nature 434, 505-509 (2005).
  2. Lagerkvist U. , 1978, “Two out of Three”: an alternative method for codon reading. Proc. Natl. Acad. Sci. USA., v.75, p. 1759 - 1762.
  3. Francis Crick. A personal View of Scientific Discovery. Basic Books, Inc., Publishers, New York . Translate into Russian: Institute of computer researches, Moscow-Ijevsk (2004), p. 98.
  4. Biebricher C.K., Eigen M., Luce R. Product analysis of RNA Generated de novo by Qb Replicase. J.Mol.Biol. 148, 369-390 (1981).
  5. Biebricher C.K., Luce R., Template-free generation of RNA species that replicate with bacteriophage T7 RNA polymerase. The EMBO Journal, 15 , Issue 13, 3458-3465 (1996).
  6. Choudhury G.K., Kejarival P.C., Chattopadhyay A. The d evices for generation of phantom leaf effect. J.Inst.Eng. ( India ) 60 , Pt.EL3, 61-66; 67-73 (1979).
  7. Gariaev P.P., Junin A.M. Phantom leaf effect. Myth or reality? Energy 10 , 46-52 (1989). In Russian. http://www.trinitas.ru/rus/doc/0202/010a/02020042.htm
  8. Gariaev P.P. Wave based genome. Monograph. Moscow . Ed. Obshestv. Pol'za. 279p. (1994). In Russian.
  9. Gariaev P.P. Wave genetic code. Monograph. Moscow . Ed. Izdatcentr. 108p. (1997). In Russian. http://rusnauka.narod.ru/lib/author/garyaev_p_p/1/
  10. Prangishvili I.V., Gariaev P.P., G.G.Tertishny, V.V.Maximenko, A.V.Mologin, E.A.Leonova, E.R.Muldashev. Spectroscopy of radiowave radiation of localized photons: path to quantum nonlocality of bioinformation processes. Sensors and systems, 9 (18), 2-13 (2000). Russian Academy of sciences. In Russian. In Russian.
  11. Gariaev P.P., Birshtein B.I., Iarochenko A.M, Marcer P.J., George G. Tertishny G.G., Leonova E.A., Kaempf U., The DNA-wave biocomputer. “CASYS” – International Journal of Computing Anticipatory Systems (ed. D.M.Dubois), Liege , Belgium , 10 , 290-310, (2001).
  12. Gustavo Glusman, Shizhen Qin, M. Raafat El-Gewely, Andrew F. Siegel, Jared C. Roach, Leroy Hood, Arian F. A. Smit. A Third Approach to Gene Prediction Suggests Thousands of Additional Human Transcribed Regions, PLOS computation biology Volume 2, Issue 3, March 2006.

 

Hosted by uCoz